Joe Peterburs trat am 30. November 1942 in das US Army Air Corps ein und wurde am 26. Januar 1943 als Luftfahrtkadett in den aktiven Dienst gerufen. Am 15. April 1944 erhielt er nach einem strengen fliegerischen Ausbildungsprogramm das Pilotenabzeichen und den Rang 2nd Lieutenant. Nach der Grundausbildung flog er Kampfersatzausbildung auf der P-40N und der A-24. Am 6. November 1944 traf Lt. Peterburs in England ein und wurde dem 55. Jagdgeschwader der 20th Fighter Group zugeteilt, er war 19 Jahre alt. Die Einheit war mit der P-51 ausgerüstet, er checkte die P-51B schnell und sammelte etwa 20 Stunden in den B-, C- und D-Modellen, bevor er in den Kampf flog. Er flog viele denkwürdige Einsätze, von denen der 49.der letzte und aufregendste war. Bei dieser Mission am 10. April 1945, schoss Joe Peterburs eine Me 262 ab die von dem berühmten deutschen Ass Walter Schuck (Tiger der Tundra) geflogen wurde. Später an diesem Tag wurde Joe Peterburs ebenfalls von feindlichem Bodenfeuer abgeschossen, während er einen Flugplatz beschoss. Er wurde gefangen genommen, entkam und kämpfte mit einer russischen Panzereinheit in die Schlacht von Wittenberg an der Elbe. Im Dezember 1951 wurde er der 12th Fighter Bomb Squadron der 18th Fighter Bomb Group zugeteilt, die die P-51D in Korea flogen. Er flog 76 Einsätze über Nordkorea, wobei er bei mehreren dieser Einsätze Verletzungen erlitt, darunter durch ein Geschoss im Kalibers .50 das durch den Propeller seiner P-51 geschleudert wurde. Ausserdem wurde er von Handfeuerwaffen die vom Boden aus auf sein Cockpit der P-51 feuerten direkt ins Gesicht getroffen. Im Jahr 1954 nahm er an Atombombentests in Nevada teil, wo er in Schützengräben saß, während eine 20-Kilotonnen-Bombe explodierte. Im Januar 1955 stieg er aus einem brennenden Lockheed T-33 aus. (Zweisitziger Jagdbomber) Von 1965 bis 1967 macht er eine Tournee als Austauschoffizier mit dem Hauptquartier des RAF Fighter Command in England. Im Herbst 1967 wurde Oberstleutnant Peterburs als Stabsoffizier nach Vietnam entsandt, wo er als Stabsoffizier das Kommando und die Kontrolle für das Kriegsgebiet zuständig war. Während der Tet-Offensive gelang es dem Vietkong, eine 122-mm-Rakete in seine Kaserne zu schleudern und sprengten sein Zimmer während er schlief. Von 1972 bis 1978 war Oberst Peterburs Deutschland zugeteilt. Er hatte zunächst die Position eines Luftwaffenverbindungsoffiziers für den Kommandeur des 7. Korps der US-Armee inne. Danach wurde er aufgefordert, die 601st und 600th Tactical Air Control Groups zu organisieren, zu bilden und zu befehligen. Er war der Hauptakteur bei der Reorganisation der 601st Tactical Air Control Wing und übernahm die Position des stellvertretenden Kommandanten für taktische Kontrollen. Während dieser Zeit war er für alle direkten Luftunterstützungs- und mobilen/festen Radarkontrolleinrichtungen verantwortlich, die in ganz Mitteleuropa das Kommando und die Kontrolle übernahmen. 1979, nach über 36 Jahren aktiven Dienstes, trat Oberst Peterburs in den Ruhestand. Er ist Kommandierender Pilot, Master Air Weapons Controller und wurde in die USAF Air Weapons Controller Hall of Fame aufgenommen. Seine militärischen Auszeichnungen umfassen: Verdienstorden der Legion of Merit, Distinguished Flying Cross mit 1 OLC, Bronze Star mit 1 OLC, Purple Heart mit 1 OLC, Air Medal mit 7 OLC, POW Medal und 32 weitere Medaillen und Auszeichnungen.
